Polymerer Strukturdetails
Di- und Polypeptide II
Am Beispiel des Hämoglobins
Primärstruktur
Aminosäuresequenz der beiden α-Ketten (im Einbuchstaben-Code) des Hämoglobins:
1 VLSPADKTNV KAAWGKVGAH AGEYGAEALE RMFLSFPTTK TYFPHFDLSH
51 GSAQVKGHGK KVADALTNAV AHVDDMPNAL SALSDLHAHK LRVDPVNFKL
101 LSHCLLVTLA AHLPAEFTPA VHASLDKFLA SVSTVLTSKY R
Aminosäuresequenz der beiden β-Ketten (im Einbuchstaben-Code) des Hämoglobins:
1 VHLTPEEKSA VTALWGKVNV DEVGGEALGR LLVVYPWTQR FFESFGDLST
51 PDAVMGNPKV KAHGKKVLGA FSDGLAHLDN LKGTFATLSE LHCDKLHVDP
101 ENFRLLGNVL VCVLAHHFGK EFTPPVQAAY QKVVAGVANA LAHKYH
Sekundärstruktur
Aminosäuresequenz der beiden α-Ketten (im Einbuchstaben-Code) des Hämoglobins
mit Kennzeichnung der verschiedenen Sekundärstruktur-Bereiche:
| Faltungstyp | Abkürzung(en) |
|---|---|
| α-Helix | (H, G) |
| β-Faltblatt | (E-sheet) |
| Knick bzw. Biegung | (T, von "Turn", S) |
| 1 | VLSPADKTNV KAAWGKVGAH AGEYGAEALE RMFLSFPTTK TYFPHFDLSH | |
| HHHHHHH HHHHHHHGGG HHHHHHHHHH HHHHHSGGGG GG TTS ST | ||
| 51 | GSAQVKGHGK KVADALTNAV AHVDDMPNAL SALSDLHAHK LRVDPVNFKL | |
| T HHHHHHHH HHHHHHHHHH HTTT HHHHS HHHHHHHHHT T HHHHHH | ||
| 101 | LSHCLLVTLA AHLPAEFTPA VHASLDKFLA SVSTVLTSKY R | |
| HHHHHHHHHH HH TTT HH HHHHHHHHHH HHHHHHHTT | ||
Aminosäuresequenz der beiden β-Ketten (im Einbuchstaben-Code) des Hämoglobins
mit Kennzeichnung der verschiedenen Sekundärstruktur-Bereiche:
| 1 | VHLTPEEKSA VTALWGKVNV DEVGGEALGR LLVVYPWTQR FFESFGDLST | |
| HHHHHH HHHHHTT H HHHHHHHHHH HHHHSGGGGG GGGGG SS | ||
| 51 | PDAVMGNPKV KAHGKKVLGA FSDGLAHLDN LKGTFATLSE LHCDKLHVDP | |
| HHHHHH HHH HHHHHHHHHH HHHHGGGTT HHHHHHHHHH HHHHTT T | ||
| 101 | ENFRLLGNVL VCVLAHHFGK EFTPPVQAAY QKVVAGVANA LAHKYH | |
| HHHHHHHHHH HHHHHHHHGG GS HHHHHHH HHHHHHHHHH HSTT | ||
Tertiärstruktur
A1 Einer der beiden α-Ketten des Hämoglobins:
A2 Des Enzyms Lysozym:
A3 Des als Protonenpumpe wirkenden Bakterienrhodopsins:
Quartärstruktur
A4 Des Hämoglobins mit den beiden α-Ketten und den beiden β-Ketten:
A5 Eines Ausschnitts auf dem Gerüstprotein Kollagen:
Externe Links
Primärstruktur Sekundärstruktur Tertiärstruktur Quartärstruktur RSCB Proteindatenbank NCBI Protein- und Nucleinsäure-Datenbank Jmol Scripting Tutorial